小児の尿路感染症は女子の方が多く、女子の３％、男子の１％に発生するとされています。小児の場合には成人と違い、尿路奇形など何らかの基礎疾患が原因となることが多いです。

その原因として膀胱尿管逆流症（VUR）、水腎症、重複尿管、神経因性膀胱、後部尿道弁などがあります。細菌が外尿道口から尿路に侵入し、感染と炎症を引き起こします。

一般的な治療として、抗生剤の投与によって改善が期待できます。しかし、特に繰り返す尿路感染を起こす場合は感染の治療だけでなく、超音波検査やCT検査などが行われ、腎盂や尿路の構造を評価します。膀胱尿管逆流（VUR）が原因で尿路感染を起こしている場合にはVURの程度を評価する必要があります。細菌感染した尿が腎臓まで逆流することにより腎盂腎炎や敗血症を起こしやすくなったり、逆流の程度が強い場合には水腎症となり長期にわたると腎臓が萎縮し腎機能障害が起きてしまうため慎重な経過フォローが必要です。重複尿管といって尿管が2本ある場合もVURを起こしやすいためエコーで腎臓の形態を確認する必要があります。水腎症の程度が強い場合や腎機能が低下する場合、尿路感染を繰り返す場合には手術が必要になることもあります。